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不動産売却時に使える譲渡所得税の特別控除や軽減措置を解説

譲渡所得税とは、不動産を売却したときに課される税金です。売却で得られた利益に対して課税されます。

不動産は取引される金額が高額なため、売却によって大きな利益(譲渡益)が出た場合には、課税額も高くなる傾向があります。

しかし、控除や軽減措置の特例を活用すれば、大幅に節税することも可能です。

確定申告の際は、控除や軽減措置の適用を忘れず申請しましょう。

ただし、税制度や各種計算は非常に複雑です。手続きに不安があれば、税金の専門家である税理士に相談することをおすすめします。

特に、相続した不動産などで「購入当時の契約書が見つからず取得費が分からない」というケースは実務でも非常に多く、計算方法によって税額が大きく変わります。判断に迷う場合は、早めに税理士に相談しておくと安心です。

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譲渡所得税とは「不動産の売却益」にかかる税金

譲渡所得税

譲渡所得税という、不動産を売却するときにかかる税金があります。

所得とは、収入から経費などを差し引いたものです。給与所得や事業所得などいくつかの種類があります。

それらの所得は合計し総所得金額を求め、まとめて課税(総合課税)するのが原則です。総合課税は、利益と損失を相殺できる「損益通算」ができます。

しかし、不動産の売却に伴って生じる譲渡所得は、他の所得とは合算せず個別に計算する「分離課税」になります。

そもそも「譲渡所得」とは?

譲渡とは、権利・財産・地位などを他人に譲り渡すことです。不動産における譲渡とは、所有している不動産(土地や建物)を売却することをいいます。

譲渡所得とは、譲渡によって得た所得のことです。土地や建物などの所有資産を売却し、そこから得られた利益に課されます。

また、所得を自分で申告する必要がある「申告分離課税」でもあります。申告を忘れて納税せず放置していると、税務署から無申告税などのペナルティが課されるので注意しましょう。

ちなみに、不動産の売却以外で申告分離税にあてはまる所得には、株式の譲渡所得や先物取引による雑所得などがあげられます。詳しくは、税務署や税理士に聞いてみましょう。

参照:国税庁「申告分離課税制度」

譲渡所得税の計算方法

不動産の譲渡所得税を計算するには、まず譲渡所得を計算しましょう。譲渡所得は、下記の計算式で算出します。

譲渡所得=収入金額-(取得費+譲渡費用)-特別控除額

収入金額は、実際に買主から受け取る売却代金のことです。固定資産税や都市計画税の精算金も含まれます。

上記で算出した譲渡所得に、税率を乗じれば譲渡所得税の課税額がわかります。税率は、譲渡した年の1月1日時点における所有期間で変わります。

ここで実務上、特に注意したいのが所有期間の数え方です。「売却した日」で5年を数えるのではなく、「売却した年の1月1日時点」で5年を超えているかどうかで判定します。

そのため、取得から実際に5年経過していても、売る年の1月1日時点ではまだ5年以下と判定され、税率が高い短期譲渡になってしまうことがあります。

所有期間が5年前後の物件は、売却のタイミングが税額を大きく左右するため、年末・年始をまたぐ売却では特に注意が必要です。

譲渡所得税=譲渡所得×税率
不動産における譲渡所得税の税率
種別 所有期間 税率
短期譲渡所得 物件を譲渡した年の1月1日時点で、所有期間が5年以下 39%(所得税30%+住民税9%)
長期譲渡所得 物件を譲渡した年の1月1日時点で、所有期間が5年超 20%(所得税15%+住民税5%)

不動産の譲渡所得による住民税は、譲渡所得税と一緒に申告をおこないます(納付は別)。そのため、上記の表でも税率を併記しています。

なお、令和19年(2037年)までは所得税額に対して2.1%の「復興特別所得税」が上乗せされます。そのため、実務上では、譲渡所得税と併せて復興特別所得税の申告も行うことになります。

参照:国税庁「短期譲渡所得の税額の計算」

参照:国税庁「長期譲渡所得の税額の計算」

譲渡所得税における「取得費」の算出方法

譲渡所得を算出するときは、収入金額から取得費を差し引きます。取得費とは、文字どおり売却不動産を取得したときにかかった費用のことです。

取得費は、大きく分けて2つあります。

  • 取得代金
  • 取得諸費用

取得代金とは、購入や建築にかかった代金です。増改築などの改良費や設備費も、取得代金に含まれます。

建物の場合は、取得代金から減価償却相当額を差し引き、経年劣化による資産価値の低下を反映させます。なお、減価償却の対象は建物のみで、土地は経年劣化しないため対象外です。

実務で見落とされやすいのが、この減価償却によって建物の取得費が当初の購入価格よりかなり小さくなる点です。「買った値段より安く売ったのに、計算上は利益が出て課税された」というケースもあるため、特に築古の建物を売る際は、減価償却後の取得費がいくらになるかを事前に確認しておくことが大切です。

取得諸費用とは、取得時に発生した代金以外の費用です。購入時の仲介手数料や印紙税などの各種税金、取得から使用するまでの借入金の利子、測量費などが該当します。

上記の取得代金や取得諸費用が不明な場合、もしくは実際の取得費が収入金額の5%を下回る場合は、収入金額の5%を取得費とする「概算取得費」を使うことも可能です。

イエコンに寄せられる相談でも、「親から相続した古い家を売りたいが、いくらで買ったのか分からない」というご質問は少なくありません。

このような場合は概算取得費を使うことになりますが、収入金額の5%しか取得費にできないと、その分譲渡所得が大きくなり税額も膨らみます。購入時の契約書や領収書が残っていないか、まずはしっかり探してみることをおすすめします。

参照:国税庁「取得費となるもの」

譲渡所得税の計算における「譲渡費用」に含まれるもの

譲渡費用は、不動産を売却するためにかかった費用のことです。具体的には、以下のものが該当します。

  • 仲介手数料
  • 売買契約書の印紙税
  • 建物の取り壊し費用(土地を売るために建物を解体した場合)
  • 立退料(借家人に立ち退いてもらうために支払った費用)
  • 違約金(売買契約済みの資産をさらに有利な条件で売却するために支払った場合)
  • 名義書換料(借地権売却にあたって地主から承諾をもらうために支払った場合)
  • 譲渡のために直接行った測量費

※抵当権抹消の登記費用、固定資産税、修繕費など、譲渡に直接関係しない費用は譲渡費用に含まれません。

参照:国税庁「譲渡費用となるもの」

不動産の譲渡所得税に使える特別控除

特例

譲渡所得税を申告するとき、要件を満たせば下記7つの特別控除を譲渡所得から差し引けます。

  • 1.公共事業などによる不動産売却で適用される5,000万円の特別控除
  • 2.マイホームを売却したときの3,000万円特別控除
  • 3.区画整理事業による土地売却で適用される2,000万円の特別控除
  • 4.宅地造成事業による土地売却で適用される1,500万円の特別控除
  • 5.平成21年から平成22年に取得した土地の譲渡で適用される1,000万円の特別控除
  • 6.農地保有の合理化などのために土地を売った場合の800万円特別控除
  • 7.低未利用土地を売った場合の100万円の特別控除

これらの特別控除は1から7の順に適用され、同一年中に複数の特例に該当する場合でも、控除額の合計は年間5,000万円が上限です。譲渡所得が控除額を下回る場合は、課税されません。

なお、それぞれの控除は対象となる譲渡の種類(収用、マイホームの売却など)が異なるため、1つの不動産売却で複数の控除をいくつも重ねて使えるわけではない点には注意しましょう。

参照:国税庁「譲渡所得の特別控除の種類」

1.公共事業などによる不動産売却で適用される5,000万円の特別控除

公共事業による収用で不動産を売却した場合、5,000万円の控除を受けられます。

詳しい要件は、下記のとおりです。

  • 収用等に伴い代替資産を取得した場合、課税の特例を受けていないこと
  • 収用による買取などの申出があった日から6か月以内に売っていること
  • 最初に買取などの申出を受けた人(もしくはその人が死亡して相続により物件を取得した人)が譲渡していること

この控除を受ける場合、確定申告のときには、公共事業の施行者から受けた公共事業用資産の買取に関する証明書などを提出する必要があります。

参照:国税庁「収用等により土地建物を売ったときの特例」

2.マイホームを売却したときの3,000万円特別控除

7つの特別控除のなかでも、とくに利用されるのが「マイホームを売却したときの3,000万円特別控除」です。

3,000万円の特別控除を受けるための要件は、下記のとおりです。

  • 自分が居住している不動産を売却すること
  • 売却の相手は親子や配偶者など特別な間柄でないこと
  • その住居に居住しなくなってから3年が過ぎた年の12月31日までに売却すること
  • 売却した年からさかのぼって2年間、この特例もしくは譲渡損失などの特例を受けていないこと

3,000万円の特別控除を受けるためには、確定申告時に下記の書類を提出します。

  • 譲渡所得の内訳書(確定申告書付表兼計算明細書)
  • 戸籍の附票の写しなど(譲渡契約締結日の前日において、住民票に記載されていた住所と売却した居住用財産の所在地とが異なる場合)

提出書類は改正で変わることがあるため、申告前に国税庁のサイトや税務署で最新の必要書類を確認しておくと確実です。

参照:国税庁「マイホームを売ったときの特例」

なお実務上、注意すべきなのが、「新居の住宅ローン控除との併用ができない」という点です。どちらを適用した方がトータルで節税になるか、売却前にシミュレーションしておくことが不可欠です。

3.区画整理事業による土地売却で適用される2,000万円の特別控除

区画整理や再開発の事業において土地を売却した場合、2,000万円の控除を受けられます。

要件として、事業をおこなう施行者が下記にあてはまることが必要です。

  • 地方公共団体
  • 独立行政法人都市再生機構
  • 市街地再開発組合
  • 地方住宅供給公社

また、譲渡が2年以上にまたがった場合、最初に売却した年以外は控除の対象にはなりません。

参照:e-Govポータル「租税特別措置法第34条」

4.宅地造成事業による土地売却で適用される1,500万円の特別控除

下記の施行者がおこなう宅地開発に伴って土地を売却した場合、1,500万円の控除を受けられます。

  • 地方公共団体
  • 独立行政法人中小企業基盤整備機構
  • 独立行政法人都市再生機構
  • 成田国際空港株式会社
  • 地方住宅供給公社または日本勤労者住宅協会

また、区画整理事業による控除と同様、売却が2年以上にまたがった場合、最初に譲渡した年しか対象にはなりません。

参照:e-Govポータル「租税特別措置法第34条の2」

5.平成21年から平成22年に取得した土地の譲渡で適用される1,000万円の特別控除

平成21年1月1日から平成22年12月31日までに取得した土地を売却した場合、1,000万円の控除を受けられます。

控除を受けるための要件は下記のとおりです。

  • 売却の相手は親子や配偶者など特別な間柄でないこと
  • 相続や遺贈、贈与、交換、代物弁済及び所有権移転外リース取引により取得した土地ではないこと
  • 売却した土地に対して、他の譲渡所得の特例を受けていないこと

確定申告時には、譲渡所得の内訳書や、売却した土地の取得年度がわかる書類の提出が必要です。

参照:国税庁「平成21年及び平成22年に取得した土地等を譲渡したときの1,000万円の特別控除」

6.農地保有の合理化などのために土地を売った場合の800万円特別控除

一定の要件にあてはまる農地の売却では、800万円の控除を受けられます。

農用地利用集積計画にもとづく農地売却などで適用されます。

対象となる農地の要件は細かいものが多いので、税理士などに相談してみましょう。

参照:e-Govポータル「租税特別措置法第34条の3」

7.低未利用土地を売った場合の100万円の特別控除

都市計画区域内にある低未利用土地(土地がまったく使われていない、もしくは近隣と比べて利用の程度が低い土地)を売却した場合、100万円の控除を受けられます。

要件として、下記のものがあります。

  • 長期譲渡所得であること
  • 売却の相手は親子や配偶者など特別な間柄でないこと
  • 売却代金が、低未利用土地の上にある建物を含めて500万円以下(市街化区域や用途地域設定区域内等における譲渡の場合は800万円以下)であること
  • 売った後に、その低未利用土地が充分に利用されること
  • 他の譲渡所得の特例を受けていないこと

確定申告時には、譲渡所得の内訳書や、上記要件を満たしているとわかる書類を提出する必要があります。

参照:国税庁「低未利用土地等を譲渡した場合の長期譲渡所得の特別控除」

譲渡所得税における控除以外の軽減措置

ここまで譲渡所得税の特別控除について紹介しましたが、控除以外にも税額の軽減や課税繰越の特例がいくつかあります。

  • 10年超所有軽減税率の特例
  • 特定居住用財産の買い換え特例
  • 売却で損失が出た場合の特例

上記3つの特例について、詳しく見ていきましょう。

10年超所有軽減税率の特例

居住用の不動産を売却して利益が出た場合、一定の要件に当てはまれば、譲渡所得税(所得税・住民税)の税率が軽減される特例です。

具体的には、下記の税率が適用されます。

譲渡所得のうち6,000万円まで 14%(所得税10%+住民税4%)
譲渡所得のうち6,000万円を超えた部分 20%(所得税15%+住民税5%)

この特例を受けるには、以下の要件を満たす必要があります。

  • 居住用の不動産であること
  • 売却した年の1月1日時点で、所有期間が10年超であること
  • 前年・前々年にこの特例を受けていないこと
  • 買い換え特例や繰り越し控除の特例など、一部の特例をいっしょに受けていないこと
  • 住まなくなった日から3年過ぎた年の12月31日までに売ること
  • 売却の相手は親子や配偶者など特別な間柄でないこと

この特例は「3,000万円の特別控除の特例」と併用できます。

重複して適用できるため、長年住んでいた住宅を売却する場合や、譲渡所得税を多く支払う人にとっては、さらにメリットとなります。

参照:国税庁「マイホームを売ったときの軽減税率の特例」

特定居住用財産の買い換え特例

この特例は、一般的に「課税の繰り延べ」といわれています。マイホーム買い換えに伴って売却した物件の課税を、新しく買った不動産を売却するときまで先延ばしにできる特例です。

この特例を受けるための要件は「売却した物件の要件」「新しい物件の要件」「その他の要件」の3種類にわけられます。

■売却した物件の要件
・売った年の1月1日時点で10年を超えて「居住」していること
・敷地は物件が取り壊された年の1月1日において、所有期間が10年を超えること
・売却価格が1億円以下であること
■新しい物件の要件
・土地面積500平米以下、床面積が50平米以上であること
・築25年以内であるか、耐震住宅であること
・もとの家を売った年の前年から翌年までの間に買うこと
■その他の要件
・物件が国内にあること
・物件を取り壊してから譲渡契約を締結するまで駐車場等に利用していないこと
・敷地の譲渡契約は物件の取り壊しの1年以内に締結されていること
・住まなくなった日から3年目の12月31日までに売却すること
・売却の相手は親子や配偶者など特別な間柄でないこと
・他の特例を前年または前々年までに受けていないこと

また、この買い換え特例と、買い換え先の住宅ローン控除は同時に使えないため、注意が必要です。実務上は、「今回の特例で繰り延べる税額」と「住宅ローン控除で受けられる減税額」のどちらが得かを試算して選ぶことになります。

判断が難しいため、買い換えを予定している場合は、売却前の段階で税理士に有利・不利を確認しておくとよいでしょう。

参照:国税庁「特定のマイホームを買い換えたときの特例」

売却で損失が出た場合の特例

物件を売却することによって、損失を出してしまうことも考えられます。

しかし、不動産の売却は分離課税であるため、基本的には他の所得と損益通算できません。

ただし、一定の要件を満たして申告をすれば、給与所得など他の所得との損益通算が可能になります。

居住用財産買い換えなどに関する譲渡損失の損益通算及び繰越控除

マイホームを買い換えたとき、売却した物件について損が出た場合に使用できる特例です。

物件売却の損失額を、その年の他の所得から控除できます。また、その年の所得では控除しきれなかった場合、以後3年間まで繰り越して控除が可能です。

例えば、物件売却で1,000万円の損失が出たとします。その年の所得が400万円であれば控除額が600万円残るため、翌年以降3年間まで繰り越して控除ができます。

参照:国税庁「マイホームを買い換えた場合に譲渡損失が生じたとき」

特定居住用財産の譲渡損失の損益通算および繰越控除

住宅ローンが残っている物件を売却して譲渡損失が出たとき、ほかの所得との通算(損益通算)ができる特例です。

ただし、この特例で損益通算できる金額には上限があり、「売却前日の住宅ローン残高」から「不動産の売却価格」を差し引いた金額(オーバーローンとなっている金額)が限度となります。売却によって生じた損失の全額を無制限に通算できるわけではない点に注意が必要です。

損失通算をしても控除しきれなかった譲渡損失は、譲渡した年の翌年以降3年間にわたって繰越控除できます。

居住用財産の買い換えに関する損益通算・繰越控除とは異なり、新しく不動産を購入する必要がありません。

物件を売却後、アパートやマンションなど賃貸物件や実家に住む場合に利用できます。

参照:国税庁「住宅ローンが残っているマイホームを売却して譲渡損失が生じたとき」

まとめ

不動産の譲渡所得税には、さまざまな特例があります。控除の特例をうまく活用すれば、課税を0円にできることもあります。

ここで必ず押さえておきたいのが、これらの特例の多くは「自動的に適用されるものではなく、確定申告をして初めて受けられる」という点です。

控除を使えば税額が0円になる場合でも、申告そのものを忘れると特例は適用されず、本来払う必要のない税金がかかってしまいます。「控除で0円になるなら申告も不要」と考えてしまうのは、実務でよくある落とし穴です。

税金や確定申告で不安があれば、税金の専門家である税理士に相談しましょう。個々の状況にあわせて、適用できる特例や最適な進め方を提案してくれます。

不動産の譲渡所得税についてよくある質問

譲渡所得税とはなんですか?

譲渡所得税とは、不動産などを売却したときに課される税金です。売却代金から取得費などの経費を差し引いた「譲渡所得」に対して課税されます。

所得と収入の違いはなんですか?

収入とは、実際に得られた金額を指します。不動産売却の場合、売却代金や固定資産税の精算金が収入です。所得は、収入から各種経費を差し引いたものをいいます。

譲渡所得税はどのように納めるのですか?

譲渡所得が発生した翌年2月16日~3月15日の期間に、確定申告をおこなって納付します。

譲渡所得税を抑える方法はありますか?

要件を満たせば利用できる特別控除があります。例えば、マイホームを売却した場合は譲渡所得から3,000万円を控除可能です。控除を活用すれば、課税額が0円になるケースもあります。

譲渡所得税や確定申告に関する疑問は、どこに相談すべきですか?

税金の専門家である、税理士に相談しましょう。税理士なら、個々の状況にあわせて最適な節税方法を提案できます。

不動産売却に関するコラムはこちら

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    更新日 : 2026年07月31日
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